Le lac du Bourget présente une stratification thermique bien marquée en cette mi-septembre. Les températures de surface ont chuté de plus de 5°C avec le rafraîchissement général de cette rentrée.

Des algues vertes sont présentes sur la couche supérieure (épilimnion). Leur développement est sans doute à lier à des apports en phosphore par les affluents grâce aux pluies de rentrée (les relarguages de fonds étant bloqués par la thermocline). Des cyanobactéries sont également présentes aux alentours des 15-17m de profondeur, provoquant un pic d'oxygène.

Les pêcheurs nous font écho du développement du zooplancton, en réponse au système, soutenant le développement des invertébrés au grand plaisir des lavarets...